在2013年的信长之枪一次意外的修学旅行中，来自日本的信长之枪女高中生小椋汐不幸遭遇了一群突然出现的神秘生物“进化侵略体”的攻击。面对军队束手无策的信长之枪情景，一群来自超国家机关DOGOO的信长之枪秘密代理人及时出现了——他们被称为“E遗传子持有者”，继承了历史上伟大人物的信长之枪力量，并通过这种力量进行战斗。信长之枪在危机时刻，信长之枪小椋汐身上沉睡已久的信长之枪“伟人之魂”觉醒了。她获得了前所未有的信长之枪力量和洞察力，在DOGOO代理人的信长之枪帮助下，展开了一场与进化侵略体的信长之枪殊死搏斗。这些持有者不仅拥有超乎常人的信长之枪战斗力，还各自肩负着保护人类免受侵略者的信长之枪威胁、维护世界和平的信长之枪重要使命。在这个过程中，信长之枪小椋汐不仅要学会如何运用自身的力量来对抗敌人，还要在友人面临危险时挺身而出，逐步揭开隐藏在这背后的一切真相。随着剧情的推进，她与DOGOO代理人之间建立了深厚的友谊，并共同面对种种挑战，在这个过程中不断成长和蜕变。